Identificação de Telomerase RNA

/Distribuição esparsa da capacidade de comutação de núcleo em SDM-EON

/Otimizando mapeamento dinâmico em arquiteturas reconfiguráveis através da utilização de escopo de detecção de tamanho variável

/Ajuste dinâmico de dificuldade usando dados de desempenho e afetivos em um jogo de plataforma

/Distributed Self-Adaptive System under Structural Uncertainty: a hierarchical ensemble approach

/Monitoramento: funcionalidade essencial no contexto da orquestração em Fog Computing

Horário: 14h

Palestrante: João Victor de Araujo Oliveira (doutorado)

Orientadora: Profa Maria Emília M. T. Walter

Título: Identificação de Telomerase RNA

Resumo: A telomerase é uma ribonucleoproteína (RNP) formada pela enzima transcriptase reversa e por RNA (em inglês, telomerase RNA - TR}. Essa RNP utiliza uma região de seu RNA como molde para adicionar múltiplas repetições de telômeros nos finais dos cromossomos. A ativação dessa atividade telomérica em células somáticas é observada em 90\% dos casos de câncer, pois ativa crescimento em células cancerígenas. As TRs vêm evoluindo rapidamente em diferentes linhagens de eucariotos, com uma grande variação de tamanho, sequência primária, estrutura secundária e caminhos de biogêneses. Além disso, sequências de TER apresentam baixa similaridade, mesmo em grupos de espécies próximas, dificultando o uso de métodos baseados em homologia. Nesta tese, propomos o uso de técnicas de extração de características, baseadas em modelos matemáticos, em sequências de TRs, visando aprimorar a identificação dessa classe de RNAs não-codificadores de proteínas. Métodos de extração de características podem indicar potenciais características úteis, que podem ser usadas na construção de modelos de aprendizado de máquina para melhor identificar e compreender as TRs. 

 

Horário: 14h20

Palestrante: Ítalo Brasileiro (doutorado)

Orientador: Prof. André Drummond

Título: Distribuição esparsa da capacidade de comutação de núcleo em SDM-EON

Resumo: As fibras multinucleadas surgem como candidatas para a expansão da capacidade de transmissão das redes ópticas elásticas. A adição de mais núcleos de propagação para os circuitos, aliado à possibilidade de comutação entre núcleos diferentes, torna as Spatial Divison Multiplexing Elastic Optical Networks (SDM-EON) potencial solução para atender a crescente demanda de tráfego. Neste trabalho, é proposto um modelo ILP para distribuição da capacidade de comutação de núcleos na rede. O modelo considera a composição dos Reconfigurable Optical Add Drop Multiplexer (ROADM), e define a arquitetura de comutação da rede, baseando-se em um valor de orçamento dado previamente. O objetivo do modelo é encontrar a melhor distribuição para a capacidade de comutação, gerando a menor taxas de bloqueio em um cenário que atenda o orçamento oferecido.

 

Horário: 14h40

Palestrante: Francisco Carlos (doutorado)

Orientador: Prof. Ricardo Jacobi 

Título: Otimizando mapeamento dinâmico em arquiteturas reconfiguráveis através da utilização de escopo de detecção de tamanho variável

Resumo: Arquiteturas reconfiguráveis tem sido amplamente utilizadas como aceleradores, provendo melhoria energética e de desempenho. Geralmente essas arquiteturas utilizam compiladores para fazer o partiocionamento hardware/software. No entanto essa abordagem possui desvantagens, como necessidade de modificação na ISA, falta de compatibilidade de software e aumento no tempo de projeto por ter que desenvolver uma ferramenta específica de mapeamento para a arquitetura alvo. Para contornar esse problema, técnicas de particionamento dinâmico foram propostas, onde o particionamento é realizado em tempo de execução, seja por um hardware dedicado ou um co-processador. Um das fases importantes no particionamento é a definição do escopo de detecção, que determina o tamanho do trecho que será movido para execução na arquitetura reconfigurável. As abordagens tradicionalmente encontradas na literatura utilizam um escopo estático que pode limitar o potencial de paralelismo que pode ser explorado pela arquitetura reconfigurável. Este trabalho propõe uma solução para superar essa limitação que consiste em utilizar um hardware dedicado para extrair informações em tempo de execução e determinar o escopo de detecção utilizado em cada trecho da aplicação. Dessa forma, pretende-se obter ganhos de desempenho e energia através dessa adaptabilidade que possibilitará a geração de configurações mais otimizadas. Essa solução será implementada na arquitetura reconfigurável ATHENA (A THin rEcoNfigurable Array), também fruto deste trabalho de doutorado. Resultados preliminares mostram que a aceleração provida pela ATHENA pode variar de 1,23x a 2,82x dependendo do escopo de detecção escolhido para uma mesma aplicação.

 

Horário: 15h

Palestrante: Marcos Paulo Cayres Rosa (mestrado)

Orientador: Prof Ricardo Jacobi

Título: Ajuste dinâmico de dificuldade usando dados de desempenho e afetivos em um jogo de plataforma

Resumo: O Ajuste Dinâmico de Dificuldade (ADD) em jogos eletrônicos pode desempenham um papel importante no aumento do envolvimento e diversão do jogador. A dificuldade de jogo pode ser adaptada de acordo com o desempenho do jogador, seu estado afetivo ou usando um modelo híbrido que combina as duas abordagens. Investigamos um mecanismo híbrido de ADD para um jogo de plataforma adaptar adequadamente seu nível de dificuldade e manter o jogador em um estado de fluxo. As três abordagens são comparadas para verificar a eficiência de cada modelo. Um jogo de plataforma de código aberto foi adaptado para suportar os algoritmos híbridos de ADD. A telemetria do jogo foi introduzida para adquirir dados de performance e o estado afetivo do jogador é estimado por meio de dados fisiológicos obtidos da Atividade Eletrodérmica (EDA) da pele. Além disso, um método que estima a dificuldade do jogo ao variar o tamanho da plataforma e a altura do salto foi desenvolvido para apoiar o mecanismo de ADD. Os jogadores testaram com os diferentes modelos de ADD e cada participante respondeu a questionários e teve seus dados coletados para fins de investigação.

 

Horário: 15h20

Palestrante: Gabriel Rodrigues (doutorado)

Orientadora: Profa. Genaína Rodrigues

Title: Distributed Self-Adaptive System under Structural Uncertainty: a hierarchical ensemble approach

Abstract: Self-adaptive systems increasingly need to coordinate themselves in a distributed environment while handling uncertainty. In special, mobile robots need to handle a myriad of unpredictable events that originates from the sources such as the dynamic environment, unreliable and battery powered components. Realizing adaptive coordinating is challenging as it involves gathering information from heterogeneous sources, identifying if active missions are affected by the changes, and how the change restricts the space of solutions. To address this challenge we propose an ensemble-based approach in which the adaptation functions are distributed among ensemble components that dynamically bind together to execute the mission. The approach is hybrid between centralized and decentralized as robots execute their local plans and have the autonomy to react to immediate observed events affecting the current tasks, while a centralized coordinator analyses detected changes in the environment and overall mission constraints.

 

Horário: 15h40

Palestrante: Breno Gustavo Soares da Costa (doutorado)

Orientadora: Profa Aletéia Favacho

Título: Monitoramento: funcionalidade essencial no contexto da orquestração em Fog Computing

Resumo: O monitoramento é uma funcionalidade essencial no contexto da orquestração em Fog Computing. O monitoramento é responsável pela coleta e entrega oportuna dos dados aos módulos da orquestração responsáveis pela tomada de decisão. 

Local: Teams MS - Equipe PPGI-316415 Seminário, Canal Seminários 2-2021

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Profa Célia Ghedini Ralha (Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.)

Coordenadora Seminários de Pós-Graduação em Informática 2-2021